海德堡巴西利卡是于1239年在编年史里第一次被提到。于1398年在其位置建筑了至今保存下来的晚哥特式建筑物主要部分。教堂目前也高于历史的中心。海德堡圣灵教堂作为管理海德堡的普法尔茨选帝侯墓。于1410年修建了祭坛,而长行堂的建筑工作拖延到1441年。教堂的主要名胜古迹是至今保存下来的鲁普雷希特三世的墓碑。17世纪世纪的大多数被打碎。
15世纪中路德维希三世选帝侯在教堂成立图书馆。大家认为,帕拉提那图书馆(Bibliotheca Palatina)是欧洲最好的图书馆。1618至1648年的三十战争以后体例伯爵按照马克西米连巴伐利亚选帝侯的命令从教堂运出传奇的图书馆。于1816年梵蒂冈只把5千本书和3524本手稿之中的885本归还到海德堡。但是目前它们存在海德堡大学。于1706年天主教徒和新教徒把圣灵教堂分配他们两方,并用隔墙互相分出,这个隔墙支持230年。目前教堂完全归新教徒所有。每个人可以登上1508年修建的教堂塔。从塔上可以看到中世纪城市的全景。